Эволюция, филогения и систематика амеб класса Tubulinea (Amoebozoa, Lobosa)

Номер гранта:	16-04-01454
Область научного знания:	биология и медицинские науки
Тип конкурса:	(а)(а) конкурс проектов фундаментальных научных исследований
Год выполнения:	2016г.
Руководитель:	Смирнов Алексей Валерьевич
Статус заявки:	поддержана

Аннотация к заявке:

Класс Tubulinea (Amoebozoa: Lobosa) - это хорошо обособленная филогенетическая ветвь амебоидных протистов, которая включает в свой состав 5 отрядов амеб. В их числе - отряд Euamoebida, объединяющий самых «типичных» представителей голых лобозных амеб, таких как Amoeba proteus , Chaos carolinense или Hartmannela catabrigiensis. В ранге отряда Arcellinida в его состав входят раковинные лобозные амебы, к нему также относятся отряды - Leptomyxida, Echinamoebida и Nolandellida. До недавнего времени группа казалась достаточно хорошо изученной, однако находки последних лет, по всей видимости, заставят нас пересмотреть почти все наши взгляды на сравнительную важность морфологических признаков и эволюционные взаимоотношения групп в пределах этой филогенетической ветви Amoebozoa. Сейчас уже очевидно, что Tubulinea «застряли» в плену наших традиционных представлений, основанных на результатах морфологических исследований и немногочисленных молекулярных данных, полученных (в основном нами же) на заре развития молекулярной систематики амебоидных протистов. Это особенно касается представителей отряда Euamoebida. Цель предлагаемого проекта - вывести изучение амебоидных протистов класса Tubulinea на современный уровень и на основе репрезентативной выборки молекулярных и морфологических данных, полученных современными методами, сформулировать новые представления о филогении и систематике амеб класса Tubulinea, эволюции клеточного покрова голых амеб, становлении их жизненных циклов и процессе приобретения раковины у амебоидных протистов. Для этого используя как методы классической ПЦР так и современные методы single-cell геномики и транскриптомики мы планируем получить репрезентативную выборку филогенетических данных для всех родов голых амеб входящих в состав группы и по результатам филогеномных исследований построить мультигенные филогенетические деревья, которые с большой вероятностью полностью разрешат паттерн ветвлений филогенетического древа в этой группе протистов. Основным результатом проекта будет новая конгруэнтная молекулярно-морфологическая система амеб класса Tubulinea, новые данные о жизненном цикле некоторых его представителей, новые взгляды на сравнительную важность традиционных морфологических признаков у лобозных амеб (число и тип строения ядра, орагнизация уроида и клеточного покрова), новые представления о путях становления жизненных циклов и эволюции раковины у раковинных лобозных амеб. В результате выполнения проекта мы планируем за три года опубликовать 6-9 статей в ведущих международных протистологических журналах индексируемых в базах Scopus /WoS/РИНЦ и представить полученные материалы на веб-сайте amoeba.ifmo.ru/species.htm, что сделает их доступными для решения широкого круга учебных и научных задач.

Аннотация к заявке приведена в авторской редакции. По состоянию на 22.05.2025