Молекулярно-генетическая характеристика мини- и микросателлитных повторов ДНК у партеногенетических видов ящериц рода Darevskia
Номер гранта: | 04-04-49436 |
Область научного знания: | биология и медицинские науки |
Тип конкурса: | («а» (до 2016))(«а») инициативные научные проекты |
Год выполнения: | 2004г. |
Руководитель: | Токарская О.Н. |
Статус заявки: | поддержана |
Аннотация к заявке:
Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг
является в настоящее время наиболее
эффективным методом анализа
генетического разнообразия и индивидуальной
изменчивости в популяциях однополых и
двуполых видов животных. Ранее проведенные
нами исследования изменчивости мини- и
микросателлитных ДНК в популяциях и семьях
партеногенетических скальных ящериц Кавказа
Darevskia dahli, D. armeniaca, D. unisexualis и
D. rostombekovi показали существование
нестабильных микросателлитных локусов,
мутации в которых вносят существенный вклад
в геномное и клональное разнообразие
партеногенетических популяциях. Наряду с
этим в ряде случаев была обнаружена
соматическая изменчивость микросателлитных
фрагментов ДНК в органах и тканях
партеногенетичсеских самок. В тоже время
молекулярные механизмы генотипической
изменчивости и природа обнаруженных нами
мутаций остаются неизученными. Целью
настоящего проекта является дальнейшее
молекулярно-генетическое исследование
изменчивости мультилокусных маркеров ДНК
у партеногенетических скальных ящериц
Кавказа, а также анализ структурных
изменений аллельных вариантов
клонированных микросателлитных
фрагментов ДНК у однополых видов
рода Darevskia?.
?В настоящее время все кавказские виды
группы "Lacerta saxicola" выделены в новый
таксон Darevskia de. nov. [Arribas, 1999].
Аннотация к отчету по результатам реализации проекта:
С помощью мультилокусного ДНК-фингерпринтинга
выявлены мутантные (GATA)n, (CT)n, (CTG)n и
(GACA)n фингерпринтные спектры у 84
исследованных потомков Darevskia unisexualis,
и 98 потомков D.armeniaca. Оценки скорости
мутаций (GATA)n микросателлитов у D.unisexualis
оказались высокими как и у двуполых видов и
составили 15% на потомка или 0.95% на фрагмент
микросателлита. Некоторые варианты мутантных
фингерпринтных спектров были широко представлены
в популяционной выборке. Соматический мозаицизм
по (GATA)n микросателлитам был обнаружен нами у
одной из четырех исследованных партеногенетических
особей. Впервые показано, что мутации в нестабильных
микросателлитных локусах вносят значительный вклад в
общий уровень генетической и клональной изменчивости
у партеногенетических ящериц D.unisexualis и
D.armeniaca. Для изучения молекулярной природы
микросателлитных мутаций была создана геномная
клонотека D. unisexualis и отобрано 400
микросателлитных клонов, содержащие ди-, три-, и
тетрануклеотидные мотивы разных типов. Секвенированы
и изучены с помощью ПЦР-амплификации 3 клона,
содержащие (GATA)n микросателлиты и 2 клона,
содержащие (TG)n микросателлиты. Обнаружен разный
уровень внутривидовой изменчивости для 200-нуклеотидных
ПЦР-продуктов 3-х (GATA)n – содержащих локусов
(Du281; Du215 и Du323) и их предполагаемых родительских
видов D.nairensis и D.valentini. Наиболеее полиморфным
оказался локус Du281-содержащий 6 ПЦР аллелей. Три
ПЦР-аллеля были обнаружены для Du215 и только один – для
Du323. Информация о первичной структуре исследованных
локусов и полиморфизме их аллельных вариантов имеет
большое значение для изучения молекулярно-генетических
причин изменчивости и мутаций микросателлитов у однополых
позвоночных, а также целей тотального маркирования мало
изученног
о пока генома однополых и двуполых видов
кавказских скальных ящериц рода Darevskia.
*В настоящее время все Кавказские скальные ящерицы группы
«Lacerta saxicola» выделены в новый таксон Darevskia Arribas
(Arribas, 1999).
Аннотации к заявке и отчету приведены в авторской редакции.
по состоянию на 28.03.2024.