Заявки, поступившие на конкурс лучших научных проектов междисциплинарных фундаментальных исследований 2018г. (конкурс «мк», тема 26-813)

Руководитель

Номер проекта

Название проекта

Аульченко Ю. С.

18-29-13005

Разработка системы агрегации, хранения, доступа и обработки больших данных результатов геномных ассоциативных исследований

Бобкова М. Р.

18-29-13001

Прогнозирование эффективности и побочных эффектов терапии ВИЧ-инфекции на основании анализа генома человека

Гаранина И. А.

18-29-13035

Применение методов машинного обучения для предсказания патогенных свойств бактерий

Гельфанд М. С.

18-29-13011

Функциональная геномика, эпигеномика и метагеномика

Гергет О. М.

18-29-13025

Новые методы формирования и применения многомерных визуальных моделей для представления, обработки, анализа, интерпретации и использования больших биологических данных в рамках метагеномных технологий

Гончаров А. Е.

18-29-13043

Геномное и метагеномное секвенирование как инструменты комплексной оценки патогенного потенциала древних микробиомов Арктики.

Гущина О. М.

18-29-13034

Применение методов и алгоритмов анализа больших данных для исследования фенотипической изменчивости населения г.о. Тольятти

Дегтярев А. Б.

18-29-13058

Построение системы консолидации и обработки данных комплексных исследований человеческого мозга и использования их для профилактики заболеваний позднего возраста

Дмитриев А. А.

18-29-13054

Сравнительный геномный анализ сортов/линий льна-долгунца (Linum usitatissimum L.), перспективных для использования в селекции, методами высокопроизводительного секвенирования

Дробинцев П. Д.

18-29-13010

Технология и средства оптимизации суперкомпьютерного моделирования для исследования геномов в медицинских и сельскохозяйственных применениях

Дружиловский Д. С.

18-29-13039

Извлечение знаний из больших массивов данных о биологической активности органических соединений

Евшин И. С.

18-29-13047

Интеграция и анализ омиксных данных для понимания регуляции генной экспрессии

Жернакова Д. В.

18-29-13032

Поиск и оценка популяционно-специфических участков метилирования ДНК на примере различных этносов Российской Федерации

Иванисенко В. А.

18-29-13016

Программно-информационная система ANDSystem: автоматическое извлечение, интеграция и представление знаний из текстов научных публикаций, баз данных и патентов в области биологии и биомедицины

Казанов М. Д.

18-29-13022

Локализациях мутаций, индуцированных эндогенными и экзогенными мутагенами, в ядре клетки раковой опухоли на основе данных 3D генома человека

Королев В. Ю.

18-29-13018

Смешанные вероятностные модели и байесовские статистические методы интеллектуального анализа динамически формируемых больших массивов данных в интересах поддержки проведения междисциплинарных научных исследований

Кубатиев А. А.

18-29-13048

Транскриптом при клеточном стрессе и стрессиндуцированном клеточном старении: деградация, стабилизация и новый смысл фрагментов РНК

Куликов А. М.

18-29-13009

Анализ ОМИКС данных для оценки роли генетического контекста при канцерогенезе

Кучеров Г. А.

18-29-13024

Mетоды глубокого обучения для задач геномики

Левицкий В. Г.

18-29-13040

Мета-анализ полногеномных данных на основе выявления и аннотации различных структурно-функциональных типов сайтов связывания транскрипционных факторов в составе композиционных элементов

Летаров А. В.

18-29-13029

Большие данные и микробная экология: развитие, динамика и биогеография сообщества бактериофагов кишечника лошади.

Липкин А. В.

18-29-13038

Генерация постгеномных структурных данных для биологических объектов методом крио-электронной микроскопии и их последующий анализ с использованием суперкомпьютерных мощностей.

Лохов П. Г.

18-29-13046

Контекстно-зависимый анализ метаболомных данных для выявления и оценки концентраций клинически значимых метаболитов.

Любецкий В. А.

18-29-13037

Гены млекопитающих, потеря которых связана с геронтологическим успехом

Малов С. В.

18-29-13003

Разработка интерактивной среды полногеномного поиска генетических ассоциаций, визуализации и интерпретации результатов

Москович Е. А.

18-29-13057

Молекулярная динамика изменений внутреннего объема биомолекулярных структур при воздействии общих анестетиков и высокого гидростатического давления.

Мошковский С. А.

18-29-13015

Интеграция больших данных геномики и скорострельной протеомики в задачах поиска клинически значимых вариантов белковых последовательностей

Нарыжный С. Н.

18-29-13026

Экспериментально-виртуальная база данных протеоформ протеома человека

Недолужко А. В.

18-29-13007

Создание автоматической системы для de novo сборки, аннотации и публикации прокариотических и митохондриальных геномов с использованием искусственных нейронных сетей

Нечаев С. К.

18-29-13013

Кластеризация в индивидуальных картах контактов и трехмерная организация хроматина

Новоселецкий В. Н.

18-29-13059

Расчет констант связывания в комплексах белок-белок с использованием искусственных нейронных сетей

Орлов С. Н.

18-29-13050

Идентификация Na+i/K+i-чувствительного транскриптома, вовлеченного в поддержание повышенного артериального давления

Орлов Ю. Л.

18-29-13061

Генерация и анализ больших геномных данных для исследования регуляции экспрессии генов с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования и иммунопреципитации хроматина

Панфилов А. В.

18-29-13008

Суперкомпьютерное моделирование структурно-функциональных изменений в сердце при миокардиальном фиброзе для изучения механизмов сердечных аритмий с целью их диагностики и терапии

Панчин Ю. В.

18-29-13014

Исследование эволюции инфекционного рака животных (Metazoa) с помощью генерации и анализа Больших геномных и пост-геномных данных.

Пенин А. А.

18-29-13017

Создание интегрированной системы для межвидового сравнения экспрессии генов у цветковых растений.

Первушин Д. Д.

18-29-13020

Идентификация и функциональная валидация опухолеспецифических изменений сплайсинга, вызванных соматическими мутациями в структурных элементах пре-мРНК

Попадьин К. Ю.

18-29-13055

Влияние мутационного груза на здоровье человека: анализ пороговых эффектов в больших популяционных и когортных выборках

Рогаев Е. И.

18-29-13051

Интегративная геномика распространенных заболеваний центральной нервной системы и функций мозга

Савостьянов А. Н.

18-29-13027

Выявление влияния полиморфизмов генов нейромедиаторных систем на личностные особенности людей на основе анализа больших данных геномного, психологического и нейрофизиологического (ЭЭГ) пролифилирования.

Самсонова М. Г.

18-29-13033

Использование больших геномных и пост-геномных данных для оптимизации селекции сельскохозяйственных культур

Семериков В. Л.

18-29-13044

Изучение геномной и эпигеномной изменчивости, связанной с адаптацией древесных растений к гетерогенной среде

Серебрийская Т. С.

18-29-13019

Разработка метода интегрированного анализа больших биологических данных на примере данных гетерогенных злокачественных опухолей

Скоблов М. Ю.

18-29-13030

Анализ больших данных в медицинской генетике

Степанов В. А.

18-29-13045

Популяционная геномика и транскриптомика человека: поиск сигналов не-нейтральной эволюции

Суплатов Д. А.

18-29-13060

Установление взаимосвязи между структурой и функциональными свойствами белков/ферментов на основе интеллектуального анализа информационных ресурсов и разработка предсказательных алгоритмов

Тишков В. И.

18-29-13049

Суперкомпьютерное моделирование формиатдегидрогеназы для поиска новых антибактериалных препаратов против биопленок стафилококков и получение биокатализаторов регенерации NADH с повышенной эффективностью

Тоневицкий А. Г.

18-29-13052

Разработка методов и алгоритмов построения транскриптомных тест-систем с максимальной совокупной информативностью

Трифонова Е. А.

18-29-13042

Характеристика транскриптома и молекулярных механизмов регуляции экспрессии генов децидуальной ткани как основа для идентификации предикторов больших акушерских синдромов

Трофимов Д. Ю.

18-29-13031

Разработка методов анализа комплекса клинических и эпигенетических данных для оценки влияния средовых факторов в пренатальном периоде на последующее развитие ребенка

Туманян В. Г.

18-29-13036

Разработка методов множественного выравнивания сильно различающихся аминокислотных и нуклеотидных последовательностей для аннотации геномов

Тяхт А. В.

18-29-13028

Разработка алгоритмов интегративной обработки больших метагеномных данных по микробиоте человека

Фишман В. С.

18-29-13021

Разработка нового подхода к молекулярной диагностике хромосомных болезней человека на основе комбинации технологий захвата конформации хромосом и массового параллельного секвенирования

Фокин В. А.

18-29-13012

Исследование нового подхода к магнитно-резонансной томографии молочных желез, повышающего качество и разнообразие собираемых данных (радиофенотипов), необходимых для эффективного радиогеномического анализа онкологических заболеваний молочных желез.

Хренова М. Г.

18-29-13006

Интермедиаты химических реакций в активных центрах белков: базы данных экспериментальных исследований и суперкомпьютерного молекулярного моделирования

Часовских Н. Ю.

18-29-13002

Разработка алгоритма предсказания сочетанного проявления шизофрении и мультифакториальных неврологических, аутоиммунных заболеваний на основе анализа данных широкомасштабных полногеномных исследований.

Чертович А. В.

18-29-13041

Моделирование структуры и динамики хроматина в соответствии с данными Hi-C для одиночных клеток.

Швецов А. В.

18-29-13056

Новые методы анализа данных методов молекулярной динамики биомакромолекулярных комплексов, включая хроматин человека

Яньшоле В. В.

18-29-13023

Создание открытой базы данных метаболома хрусталиков глаза позвоночных животных и анализ факторов, влияющих на метаболом хрусталиков