Средства Фонда формируются за счет:
- государственных ассигнований, составляющих до 6% от средств, выделяемых на гражданскую науку в бюджете Российской Федерации;
- добровольных взносов предприятий, учреждении, организаций и граждан, в том числе иностранных юридических и физических лиц.
Данные о финансировании РФФИ из бюджета государства с 1993 года.
Средства Фонда используются на:
- финансирование научных проектов и иных мероприятий, отобранных на конкурсах, проводимых Фондом;
- приобретение и распространение научной информации в целях поддержки фундаментальных научных исследований;
- содержание аппарата, развитие материально-технической и информационной базы Фонда, проведение экспертиз.
Распределение средств между различными видами деятельности РФФИ ежегодно утверждается Советом Фонда. Основная часть средств Фонда (более 70%) направляется на финансирование инициативных научных проектов, выполняемых небольшими научными коллективами (до 10 человек) пли отдельными учеными. Инициативный проект финансируется не более трех лет. На графике представлено распределение бюджетных средств по видам деятельности РФФИ в 2014 г.
Между областями знания финансовые средства распределяются с учетом количества поступающих заявок на конкурс инициативных проектов. На графике представлено распределение бюджетных средств между областями знания в 2014г.